Il toponimo è attestato per la prima volta nel 1128 come Ripomarrancia. Mentre il primo elemento del nome è il latino ripa (“riva”), il secondo è più incerto e potrebbe derivare da un nome di persona romano Arranciae (forse di origine etrusca). Il toponimo potrebbe però derivare dall’italiano antico pomarancia, col significato di “melarancia”.

Parte del territorio comunale fu l’epicentro del sisma del 2 agosto 1853, che raggiunse la magnitudo 4,63 della scala Richter ed il V-VI grado della scala Mercalli, e del terremoto delle Colline Metallifere del 19 agosto 1970, che raggiunse la magnitudo 5,01 della Scala Richter ed il VI grado della Mercalli.

Lo stemma del Comune di Pomarance, di antica origine, è stato ufficialmente riconosciuto con decreto del capo del Governo del 3 luglio 1930.

Il gonfalone, concesso con decreto del presidente della Repubblica del 12 gennaio 2007, è costituito da un drappo di rosso caricato dallo stemma comunale.